Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP73A6NFT4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP73A6NFT4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFAP73A6NFT4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFAP73A6NFT4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms