Protein–RNA interactions for Protein: A6NDI0

TRIM49B, Putative tripartite motif-containing protein 49B, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49BA6NDI0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49BA6NDI0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49BA6NDI0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49BA6NDI0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM49BA6NDI0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM49BA6NDI0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM49BA6NDI0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM49BA6NDI0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms