Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CPED1A4D0V7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CPED1A4D0V7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPED1A4D0V7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPED1A4D0V7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms