Protein–RNA interactions for Protein: A1A580

KRTAP23-1, Keratin-associated protein 23-1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP23-1A1A580 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
KRTAP23-1A1A580 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP23-1A1A580 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms