Protein–RNA interactions for Protein: A1A4G5

LNP1, Leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1A1A4G5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNP1A1A4G5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LNP1A1A4G5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LNP1A1A4G5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LNP1A1A4G5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LNP1A1A4G5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LNP1A1A4G5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms