Protein–RNA interactions for Protein: A0A5B9

TRBC2, T-cell receptor beta-2 chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBC2A0A5B9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBC2A0A5B9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBC2A0A5B9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRBC2A0A5B9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBC2A0A5B9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms