Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
A0A1W2PQD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PQD3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A1W2PQD3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A1W2PQD3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms