Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRA0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RRA0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A0A0U1RRA0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
A0A0U1RRA0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
A0A0U1RRA0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms