Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC163A0A0D9SF12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC163A0A0D9SF12 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC163A0A0D9SF12 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC163A0A0D9SF12 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms