Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CIZ1Q9ULV3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CIZ1Q9ULV3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms