Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TSPAN16Q9UKR8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TSPAN16Q9UKR8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms