Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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RABGEF1Q9UJ41 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
RABGEF1Q9UJ41 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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