Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SFMBT1Q9UHJ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms