Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRP68Q9UHB9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms