Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF2Q9C093 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms