Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FOXQ1Q9C009 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FOXQ1Q9C009 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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FOXQ1Q9C009 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FOXQ1Q9C009 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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