Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NIFKQ9BYG3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms