Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SPATA16Q9BXB7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms