Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NUP58Q9BVL2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NUP58Q9BVL2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms