Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC39A3Q9BRY0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms