Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TREX2Q9BQ50 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms