Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VAT1Q99536 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms