Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRAMP1Q96RY5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRAMP1Q96RY5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRAMP1Q96RY5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRAMP1Q96RY5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms