Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALS2CR12Q96Q35 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms