Protein–RNA interactions for Protein: Q96E35

ZMYND19, Zinc finger MYND domain-containing protein 19, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND19Q96E35 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZMYND19Q96E35 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms