Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM63Q969Q1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM63Q969Q1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM63Q969Q1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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