Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00301Q8NCQ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms