Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BEND4Q6ZU67 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BEND4Q6ZU67 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms