Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms