Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LRRC8EQ6NSJ5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms