Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PRAMEF6Q5VXH4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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PRAMEF6Q5VXH4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRAMEF6Q5VXH4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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