Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C9orf135Q5VTT2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms