Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COLEC12Q5KU26 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COLEC12Q5KU26 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms