Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC93Q567U6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms