Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN3Q4LDR2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms