Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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HIST3H3Q16695 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HIST3H3Q16695 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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