Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CTF1Q16619 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CTF1Q16619 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTF1Q16619 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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