Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ACKR1Q16570 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACKR1Q16570 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms