Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNCBQ16143 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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