Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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