Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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SPIDRQ14159 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPIDRQ14159 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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