Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CBX3Q13185 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CBX3Q13185 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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CBX3Q13185 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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