Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNIP3Q12983 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms