Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.611e-6■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 GINS1-203ENST00000481735 396 ntTSL 35.97□□□□□ -1.453e-12■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 YTHDC2-201ENST00000161863 6316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.646e-13■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 YTHDC2-205ENST00000512600 6708 ntTSL 24.55□□□□□ -1.686e-13■■□□□ 12.6
ILF3Q12906 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 AARSD1-204ENST00000436545 680 ntTSL 314.96□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PTGES3L-AARSD1-205ENST00000423601 584 ntTSL 314.6□□□□□ -0.072e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.142e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 AARSD1-217ENST00000591910 726 ntTSL 312.74□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 AARSD1-205ENST00000441280 983 ntTSL 212.05□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 AARSD1-206ENST00000450475 783 ntTSL 511.93□□□□□ -0.52e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 AARSD1-203ENST00000430739 752 ntTSL 311.55□□□□□ -0.562e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.72e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 AARSD1-201ENST00000416949 478 ntTSL 410.05□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)16.67■□□□□ 0.269e-9■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PRKCSH-213ENST00000591510 591 ntTSL 315.8■□□□□ 0.129e-9■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.248e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 516.35■□□□□ 0.218e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.512e-8■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.283e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.223e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 310.83□□□□□ -0.682e-6■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.815e-11■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.25e-11■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 FP700125.1-201ENST00000628622 3262 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.932e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-210ENST00000540951 572 ntTSL 318.97■□□□□ 0.632e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-218ENST00000545380 2373 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.172e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-211ENST00000541434 1112 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.062e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-212ENST00000542447 4223 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.692e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CADM1-203ENST00000452722 8588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.114e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 512.56□□□□□ -0.44e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.024e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.948e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.081e-6■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CTSB-222ENST00000531551 1855 ntTSL 1 (best)17.33■□□□□ 0.375e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 417.15■□□□□ 0.345e-7■■□□□ 12.5
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ILF3Q12906 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.055e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.045e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 515.22■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-230ENST00000534149 524 ntTSL 414.95□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-224ENST00000532392 570 ntTSL 414.41□□□□□ -0.15e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 414.41□□□□□ -0.15e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 414.38□□□□□ -0.115e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-217ENST00000530296 561 ntTSL 413.93□□□□□ -0.185e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 411.09□□□□□ -0.635e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-212ENST00000526645 559 ntTSL 410.85□□□□□ -0.675e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 PCBP2-206ENST00000455667 2741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-13■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 48.63□□□□□ -1.035e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 EEFSEC-204ENST00000484438 640 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-7■■□□□ 12.5
ILF3Q12906 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.171e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 RNF31-203ENST00000491351 1804 ntTSL 523.64■■□□□ 1.382e-7■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.271e-6■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.036e-21■■□□□ 12.4
ILF3Q12906 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.011e-6■■□□□ 12.4
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