Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPOCK1Q08629 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms