Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLEQ07864 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLEQ07864 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms