Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms