Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms