Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIM1P81133 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIM1P81133 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIM1P81133 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIM1P81133 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIM1P81133 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIM1P81133 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIM1P81133 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIM1P81133 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms