Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms